illumina二代測序儀

更新時間：2022-06-12

簡要描述：

illumina二代測序儀MiSeq系統可通過各種測序應用為您的研究提供便利。它能夠自動生成雙端read，每次運行的產出高達15 Gb，每條read可提供600多個堿基的測序數據。它使用的文庫制備試劑盒已針對多種應用進行了優化，包括靶向基因測序、小型基因組測序、擴增子測序、16S宏基因組學等。

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Illumina公司推出的MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數據分析的新款測序儀，每次運行能產生超過1Gb的數據，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準確性，讓它成為快速且經濟的遺傳分析的理想平臺，適合廣泛的應用。同時Illumina已被FDA大量采購并即將通過FDA認證，12年10月，MiSeq系統的測序通量已升級至8G左右。升級通過兩個方面完成，一個是cluster密度的增大，升級后cluster密度增加至15-17million，而pair-end讀取的reads數目將會增加至30-34million；另一方面是通過測序讀長而提升通量，測序讀長達到2*300bp，同時測序速度也有所提升。目前，Broad研究院已經利用現有試劑實現了單端測序300bp讀長，Illumina目前內部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些，都是保證在高質量數據結果的前提下完成的。

MiSeq性能參數

Illumina MiSeq測序時間和數據量

讀長（bp）	時間	總數據量	Q30
1×36	～4 hrs	540-610 Mb	﹥90%
2×25	～5.5 hrs	750-850 Mb	﹥90%
2×100	～16.5 hrs	3.0-3.4 Gb	﹥85%
2×150	～24 hrs	4.5-5.1 Gb	﹥80%
2×250	～39 hrs	7.5-8.5 Gb	﹥70%

Illumina MiSeq讀取量比對

運行類型	通過過濾的讀取（百萬）
運行類型	升級前	升級后
單端讀取	5-7 M	15-17 M
末端配對讀取	10-14 M	30-34 M

工作流程

illumina二代測序儀 MiSeq四大特性

1、較短的實驗周期：從樣品制備開始需要8小時即可得到超過100M的高質量測序結果。

2、便捷的樣品制備流程：需50ngDNA模板，2小時的自動化操作就可以完成全部樣品制備工作。

3、測序原理：MiSeq繼續GA和HiSeq平臺的邊合成邊測序的化學原理。

4、完整的整合功能：MiSeq可以獨立完成簇生成，雙向測序及數據分析工作，讓經費和實驗室空間不再成為NGS研究的障礙。

illumina二代測序儀 MiSeq應用范圍

1、轉錄組測序

派森諾MiSeq測序平臺是基因組已測序物種的轉錄組分析平臺。公司技術團隊目前已完成了包括斑馬魚在內的多種植物、動物的轉錄組測序及分析。

2、宏基因組16S rDNA單V區測序

對16s rDNA的單V區(V3\V4)進行高通量測序，鑒定細菌群和古生菌群。派森諾的技術團隊使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區并結合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區成功的對雞的腸道環境細菌進行了鑒定。

3、Small RNA測序

1*35bp的讀長配合了小RNA的測序長度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術團隊目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。

4、重測序：包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。

Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序，每次運行即可完成一個微生物基因組測序。2011年12月27日，派森諾的技術團隊利用MiSeq一次運行同時完成了乳酸菌（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對至參考序列，基因組實現全覆蓋，同時檢測到了多種結構變異，包括插入、缺失和SNP位點，并且檢測到了全部質粒。